0.媒介经典三级片
常言谈，兵欲善其事必先利其器，行军干戈要有一个趁手的武器，孙悟空有了金箍棒，就如虎添翼。
议论医学影像的老迈也需要好的器具，往往和CT、MRI等数据打交谈，莫得个好器具，还真搞不定。在这里，老弟先容一款神器 3D Slicer。
有了 3D Slicer，数据使命不再败兴，干起活来就像吃馒头加老干妈，越来越隽永。背面会推出一些使用教程，简短好用。
为什么要先容这个器具呢？大壮竭诚不会先容没用的东西。
基于深度学习的医学影像议论，基本齐是使用的是有监督学习算法，这就要去提供具有真值（ground truth）的标注文献，生成窥察集和测试集，一般用于图像分割。
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1.3D Slicer 先容
3D Slicer是一款免费的开源软件，由全寰宇的开采者共同开爱戴，好意思国国立卫生议论院(NIH)一直很补助这个技俩。
软件主要用于医学、生物医学和其他3D图像和网格的可视化、贬责、分割、配准和分析，方针和导航图像带领法子。用于医学图像数据集可视化和分析。
允许议论东谈主员二次开采，整个的功能齐不错用Python和C 讲话终端，况兼不错推广。老迈们不错凭据我方科室能够议论需求开采一些荒芜插件，终端高效的使命。
for example:
王主任，每次看片齐很累，不错帮他开采出一个基于AI模子检测功能插件，能自动筛选出风险区域，然后王主任眷注这些区域即可，无谓每个方位齐看，不错爽快王主任的珍重技艺和元气心灵。
2.3D Slicer的应用例如
（1）图像分割标注
使用 Segment Editor 模块创建手术方针、创建高质料数据集，其中包括窥察集和测试集，用于深度学习算法窥察和测试使用
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图1 图像分割
（2）图像分析
一些插件不错对CT和MRI分析，擢升会诊的遵循。
色色淫来自瑞士的Rudolf Bumm教悔，就开采了一个COVID-19CT评估的插件，不错自动终端对肺部CT影像的分割和分析，还具有肺部的定量容积分析，快速切片和容积渲染的可视化功能，同期还能生成PDF诠释生成。
从描写中看，这玩意还挺灵验，这个插件是使用python开采的，大壮竭诚很擅长啊
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图2 COVID-19 的肺部 CT 分析
（3）手术导航
这里主先容3D Slicer 用于乳腺癌手术的及时导航应用。
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图2 3D Slicer 用于乳腺癌手术的及时导航
超声导航可能使肿瘤切除更准确，改善肿瘤切除术的后果。乳腺癌是女性最常见的癌症，而肿块切除术是其首选的颐养要领。
医师老迈们使用超声波的手术导航要领改善肿瘤切除术后果，在肿瘤定位针、超声探头和烧灼器上装配了位置传感器，并行使及时追踪信息生成三维导航视图。由八名外科入院医师在乳房模子上对该系统进行了表率线定位法子的测试。两位教授丰富的肿瘤外科医师在6名需要切除肿块的肿瘤患者身上测试了临床安全性和可行性。
与对照法子比拟，导航导致切除的组织明白减少（10.3 ± 4.4 vs. 18.6 ± 8.7 g，p = 0.01），在模子实验中，肿瘤阳性边际的数目较少（1/8 vs. 4/8）。举座后果如故很好的，照旧集成在关连临床建筑中了。
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图3 模拟测试1
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图3 模拟测试2
（3）AI 辅助医学影像分割
使用 Segment Editor 中的 NVidia AI 器具，使用事前窥察的模子自动分割剖解结构。
这就很灵验了，各人不错窥察我方的分割模子，借助软件帮你自动分割影像。
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图5 使用 NVidia Clara的 AI 辅助分割
（4）机器东谈主辅助烦躁
将轻量级机器东谈主（库卡）集成到图像带领的颐养系统中。使用OpenIGTLink接口截至带有切片机模块的机器手臂，并在CT图像数据中可视化现时位置，从而进一步截至机器东谈主的怒放。
有点手术机器东谈主的真义，不外手术机器东谈主王者是加拿大的达芬奇。是他们2013年作念的，面前看议论如故具有前瞻性的。
（注：库卡本来是德国的公司，交易不好被 好意思的 收购了，也算是中国企业吧
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，是机器东谈主三各人眷属之一）图片
图6 kuka集成机器东谈主
（5） 纤维束成像
UKF Tractography 使用无迹卡尔曼滤波器（UKF）联想 DWI 图像的纤维束成像。
卡尔曼滤波是一个工科很盛名的要领，是一种行使线性系统情状方程，通过系统输入输出不雅测数据，对系统情状进行最优预计的算法
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图7 纤维束成像
（6）超声追踪和针头导航
使用追踪超声影像终端对针头的导航，不错改善莫得教授操作家的皮肾穿刺造瘘术的表示。
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图8 超声追踪和针头导航
（7）辐射颐养可视化和分析
SlicerRT 推广是用于 3D Slicer 的辐射颐养器具包，包含 DICOM RT 导入/导出、可视化和分析。
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图9 适合性辐射颐养
（8）及时三维超声重建
使用SlicerIGT和SlicerIGSIO推广，从及时追踪的超声中重建三维体积
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图10 及时 3D 超声重建
（9）SlicerVR 臆造施行交互
不错3D 视图中涌现的整个本体（体积渲染、及时手术导航、纤维束成像在臆造施行中涌现和交互。
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图11 臆造施行
（10）FreeSurfer分析
从 FreeSurfer 导入体积、分段、名义，然后进行裁剪和分析。
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图12 FreeSurfer
3.大壮点评经典三级片
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